2019年冬季江苏部分地区鸡传染性支气管炎病毒S1基因遗传进化分析

摘要：

为了解2019年冬季江苏省部分地区鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的流行情况,本试验对江苏省内3个地区分离的23株IBV的S1基因进行了遗传进化分析,首先对采集的病料进行毒株分离并进行病毒核酸测序,然后采用MEGA 5.2、Simplot、Megalign、RDP4等分析软件对IBV的S1基因序列进行分析.结果显示:23株分离毒株中有7株为HN08型(占30.4％),另外16株为QX型(占69.6％),其中分离毒株CKCHJSCZ1912-5的S1基因发生了重组,其假定亲本分别为QX型QXL87毒株与HN08型SAIBK毒株,说明连云港地区减毒活疫苗的使用是IBV发生重组的关键因素,但因重组片段不大,所以该毒株没有单独形成进化分支.通过Megalign软件分析分离毒株之间的一致性,得出23株IBV分离毒株间核苷酸序列和氨基酸序列一致性分别为82.9％～99.9％和79.2％～99.8％.通过对江苏省IBV分离毒株与参考株进行遗传进化分析,发现23株分离毒株S1基因发生较大程度变异,分离毒株与参考株间的一致性差异大,推测S1基因的多样性可能是目前导致免疫失败的一个重要原因.毒株变异为鸡传染性支气管炎的防控工作带来了难题,也为研制新型疫苗提供指导.

关键词：鸡传染性支气管炎病毒、S1基因、遗传进化分析、重组

所属期刊栏目：57

分类号：S831(家禽)

资助基金：广东省畜禽地方品种保护与开发利用提升工程4300-F18260

在线出版日期：2022-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：7-11,18