2株鸡细小病毒全基因组序列测定与分析

摘要：

为了解近年来鸡细小病毒(ChPV)流行毒株的全基因组基因特征和分子进化规律,本研究对2018年从山东潍坊和河南濮阳肠炎综合征病例中检测到的2株ChPV-SDWF和ChPV-HNPY进行了基因组克隆和序列测定.应用MEGA 5.02、SimPlot 3.5.1、Phyre 2等生物信息学软件对基因结构、遗传变异、重组情况及VP2蛋白3D结构进行了分析.结果显示,2株分离株基因组序列长度均为4 615 bp,核苷酸同源性为96.9％;ChPV-SDWF株和ChPV-HNPY株与不同参考株的核苷酸同源性分别为80.6％～95.7％、80.1％～95.4％.2株分离株与美国火鸡细小病毒参考株TuPV-260株和匈牙利ChPV参考株ChPV-ABU-Pl亲缘关系较近,属于同一个分支.分离株没有出现重组现象,核苷酸同源性由高到低依次为NS1基因、VP1基因、VP2基因.VP2蛋白3D结构含有8条反向平行的β折叠围成的桶,表面存在4个Loop,其中Loop3和Loop4变异最大.本研究可进一步了解我国ChPV的基因特征和遗传变异情况,为ChPV的监测及防控提供理论依据.

关键词：鸡细小病毒、基因组、遗传进化

所属期刊栏目：56

分类号：S852.65+9.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;山东省自然科学基金;山东省现代农业产业技术体系家禽创新团队项目

在线出版日期：2021-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：15-19,封3