10株猪流行性腹泻病毒序列分析

摘要：

为了分析2015-2018年北方地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,通过RT-PCR分段扩增、测序,获得10株PEDV S基因序列.分析发现,10株S基因核苷酸序列同源性为96.8％～ 99.4％,推导编码的氨基酸序列同源性为96.5％～99.3％;与参考株核苷酸序列同源性为93.4％～99.5％,与参考株氨基酸序列同源性为92.0％～ 99.4％.其中,4株序列基因长度均为4 161.nt,编码1 386个氨基酸;6株序列基因长度均为4 158 nt,编码1 385个氨基酸,与目前流行的变异株和经典株CV777相比,这6株S基因推导的氨基酸序列已分别在131位、1 196位出现1个氨基酸缺失,在进化树中已形成多个小分支.由此表明,我国PEDV在流行过程中已出现较大变异.作者研究结果为监测和分析我国PEDV的变异和演化提供了有价值的基因信息数据.

关键词：猪流行性腹泻、S基因、序列测定、变异分析

所属期刊栏目：55

分类号：S852.65+1(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2020-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：34-37