2013-2014年黑龙江地区猪流行性腹泻病毒检测及M基因的遗传进化分析
猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的一种严重的病毒性传染病.本试验于2013-2014年在黑龙江省6个地级市的10个规模化猪场采集新生哺乳仔猪临床表现为腹泻症状的粪便与小肠,进行RT-PCR检测,表明PEDV检出率为56％,PEDV+ TGEV检出率为6％,PRV检出率为10％,TGEV检出率为10％,结果表明,引起黑龙江省规模化猪场新生仔猪腹泻的主要病原是PEDV,同时也存在与其他腹泻病毒的混合感染.针对阳性病料扩增出的6株PEDV的M基因序列进行遗传进化分析,6株PEDV-M基因序列之间的核苷酸同源性为98.2％～ 99％,与疫苗株CV777的核苷酸同源性为97.6％～98.2％.利用MEGA 6.0构建遗传进化树,结果显示,扩增出的6条PEDV-M基因的遗传进化树分为两大系,大部分遗传距离较近,处于同一分支.其中LJJHD-M-13和LJJQ-M-14与泰国KU06RB08、泰国KU07 RB08的亲缘关系较近,LJJC-M-14、LJJJ-M-14、LJJH-M-13、LJMM-M-14这4株毒株与韩国M1595、韩国CPF259的亲缘关系较近.同时扩增出的6条PEDV-M基因与CV777毒株非一系,与其亲缘关系较远,说明这些地区的PEDV流行毒株已经发生变异,形成了独特的流行进化分支.因此,本试验通过对变异毒株基因序列进行分析,以期为研制新的疫苗和预防控制该病提供实验数据和理论基础.
猪流行性腹泻病毒、M基因、序列分析、遗传进化分析
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S852.62(动物医学（兽医学）)
黑龙江省科学基金项目C2016028
2018-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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