大鲵致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因的生物信息学分析

摘要：

根据嗜水气单胞菌的溶血素(HlyA)、外膜蛋白(Omps)及丝氨酸蛋白酶(AhpA)基因,分别设计3对特异性引物.通过3重PCR法对三对基因进行克隆与生物信息学分析.溶血素、外膜蛋白及丝氨酸蛋白酶基因的开放阅读框分别为1 863 bp、1 071 bp及894 bp,分别编码621、357及298个氨基酸.同时,对其氨基酸序列进行系统进化树构建、蛋白理化性质分析、蛋白信号区域和结构区域分析、蛋白二级结构预测、蛋白三级结构预测及蛋白免疫原性分析.本研究对大鲵源致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因进行生物信息学分析,为进一步研究嗜水气单胞菌保护性抗原多样性而提供理论基础.

关键词：大鲵、嗜水气单胞菌、毒力基因、生物信息学

所属期刊栏目：51

分类号：S941.42(水产保护学)

资助基金：重庆市科委应用开发计划项目cstc2013yykfA800-06;重庆市科委农业科技成果转化资金项目cstc2013jcsf-nycg-zhA80008

在线出版日期：2015-07-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：83-86,后插9