猪博卡病毒(重庆株)NP1部分基因的克隆测序及生物信息学分析

摘要：

通过设计特异性引物建立基于猪博卡病毒(Porcine Bocavivus,PBoV)NP1基因的特异性PCR方法,从重庆地区猪血液中扩增出PBoV-NP1的部分基因片段,进行基因测序,并与GenBank公布的PBoV、HBoV及PPV基因序列进行生物信息学分析.结果显示:本次试验克隆得到的PBoV重庆株NP1部分基因片段大小为257 bp,与已公布的PBoV-NP1基因的同源性为97.3％～100％;重庆株与PBoV瑞典株、PBoV中国株属同一进化分支,且PBoV重庆株NP1基因与PBoV瑞典株NP1基因亲缘性非常接近;PBoV重庆株NP1基因与GenBank公布的猪PBoV-NP1和1个人HBoV st1聚在博卡病毒一大分支,与PPV分属两大分支,而HBoVst1株又单独形成另一簇.这表明,PBoV重庆毒株与国外毒株的亲缘性非常接近,推测重庆地区猪群中感染的PBoV可能是通过引进或者进口国外动物性产品而传播感染猪群.

关键词：猪博卡病毒、NP1基因、克隆、生物信息学

所属期刊栏目：51

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2015-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：14-16