我国部分地区禽流感病毒流行株的分子流行病学调查

摘要：

为了解近年来禽流感病毒在我国部分地区家禽中的流行情况,深入阐明我国禽流感病毒流行株的HA和NP基因的进化关系及遗传进化过程,本研究采用RT-PCR方法,对我国广西、河北、湖南、河南、山东等地采集的病料进行检测,并对其中19株H5N1阳性分离株进行HA和NP基因测序,将测定的序列与参照序列对比,运用DNAStar软件对核苷酸序列进行同源性和遗传进化分析.结果表明,分离的禽流感流行株因地域的不同、时间的差异、宿主的不同,禽流感病毒HA基因核昔酸序列的同源性在96.0％～99.7％之间,推导的氨基酸序列的同源性在95.8％～99.6％之间;禽流感病毒NP基因核苷酸序列的同源性在68.2％～99.7％之间,推导的氨基酸序列的同源性在65.5％～99.8％之间.各分离株在遗传进化树上并不集中处于一个分枝中,而是处于遗传进化树的不同位置,说明我国禽流感病毒可能已经发生部分变异,这些禽流感病毒起源于不同的种系,但可能具有共同的祖先.

关键词：禽流感、分子流行病学、HA基因、NP基因、序列分析、遗传进化

所属期刊栏目：49

分类号：S858.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：科技基础性工作专项:畜禽重要疫病流行病学调查2012FY111000

在线出版日期：2013-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：9-12