鸡传染性支气管炎病毒中国地方分离株膜蛋白基因的克隆及序列分析

摘要：

本研究选取有代表意义的9株鸡传染性支气管炎病毒(IBV)国内分离株,利用所设计的一对特异引物,通过RT-PCR的方法成功地扩增了膜蛋白基因即M基因全长片段,通过克隆、序列测定获得了9个分离毒株M基因的全长核苷酸序列.并将各IBV国内分离株与GenBank中注册的一些毒株的M基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行比较、系统进化关系分析发现:IBV中国地方分离毒株大部分属于Mass型;不同毒株间存着重组、缺失、插入及点突变等变异,从ATG至第150 bp区段的核苷酸序列变异频率最高;IBV中国地方分离株M基因的变异属于高频率的同义突变;国内的IBV分离株分为两个基因群,Ⅰ群分离毒株与GenBank中Mass型的毒株亲缘关系较近,毒株间核苷酸序列同源性为95.7%～100%,其相应的氨基酸序列同源性为98.2%～100%;Ⅱ群分离毒株与众多参考毒株的亲缘关系都比较远,毒株间彼此核苷酸序列同源性为89.7%～94.9%,氨基酸序列同源性为92.0%～96.0%.

关键词：IBV分离株、克隆、序列分析、膜蛋白基因

所属期刊栏目：42

分类号：S8(畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂)

资助基金：国家自然科学基金398932902;广东省教育厅SARS专项资助项目粤教科[2003]87号

在线出版日期：2006-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：3-6