三重qPCR法快速检测肺炎克雷伯菌的方法建立与应用
目的 建立三重qPCR法(实时荧光定量)快速检测肺炎克雷伯氏菌rcsA和23s RNA基因,期以快速精准诊断呼吸道肺炎克雷伯氏菌感染,为早期精准治疗提供依据.方法 根据GenBank公布的肺炎克雷伯氏菌rcsA和23s RNA基因序列选择保守区设计测序引物,高保真扩增东莞樟木头医院分离到的95株肺炎克雷伯氏菌rcsA和23s RNA基因,经测序比对后,避开变异区和突变点分别设计检测引物和探针,建立三重qPCR方法直接检测临床呼吸道样本,并与培养及测序法比较,验证其诊断灵敏度和特异性等性能指标.结果 三重qPCR法检测肺炎克雷伯氏菌rcsA和23s RNA基因,其检测下限低至2 cfu/PCR,检测灵敏度98.9%(94/95),检测特异性97.9%(93/95);诊断灵敏度98.6%(424/430),诊断特异性98.8%(2295/2324);从样品处理到报告结果≤1.2h.结论 该方法简便、快速、灵敏度高、特异性好,可实现呼吸道肺炎克雷伯氏菌感染的快速与精准诊断,为早期精准治疗赢得时间.
肺炎克雷伯氏菌、精准诊断、qPCR、rcsA基因、23s RNA基因
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R378(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
东莞市樟木头科技项目2015105101232
2017-08-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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