潮州地区人乳头瘤病毒52型L1基因多态性分析

摘要：

目的 研究潮州地区优势型别人乳头瘤病毒(HPV)52型L1基因多态性.为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据.方法 采用核酸分子快速导流杂交分型技术(HybriMax)检出HPV52,提取101例HPV52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过4对特异性引物分别扩增HPV52-L1编码区全序列,进行测序及BLAST多态性分析.结果 本研究成功获得73条HPV52 L1基因全序列(1590 bp).该序列与天津参考株(GQ472848)的一致性为99%.在潮州地区发现的所有L1基因序列中有31个碱基是可发生变异的,其中25种为同义突变,6种为有义突变.根据基因多态性分东亚群和欧洲群2群.东亚群有13组,其中CZ52A105是本地最常见的变异株,占61.64% (45/73),该组称为潮州地方株,其编码序列与泰国清迈报道的IN141070株(HQ537743)完全匹配,其余各组(21/73)多态性国际上均尚未报道,他们均与天津报道的TJ49-52(GQ472848)株以及泰国报道的IN141070(HQ537743)株亲缘关系最近,有1～6个碱基不同.欧洲群有2组为 CZ52E928(2/73)和CZ52E136(5/73),其基因序列分别与德国REF(X74481)株和北美洲Qv03719(HQ537745)株的L1全序列完全匹配.结论 潮州地区HPV52-L1基因多态性与中国东南部和东南亚国家报道的类似,CZ52A105是潮州地方株.

关键词：人乳头瘤病毒、52型、L1基因、序列分析、多态性

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分类号：R694.13(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)

资助基金：国家自然科学基金81101329;广东省医学科研基金A2011760

在线出版日期：2013-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：793-798