利用TCGA数据库分析识别胃癌预后相关的特异性miRNA

摘要：

目的 探讨特异性miRNA与胃癌预后相关性.方法 从TCGA数据库下载203例胃癌及24个癌旁组织miRNA和mRNA表达谱数据及相应的临床资料.应用"edgeR"R包分别对比分析癌与癌旁样本miRNAs及mRNA差异性.结合生存资料,采用KM曲线法进行差异miRNAs及靶基因生存分析.针对筛选出的靶基因进行KEGG信号通路富集分析及GO功能注释.结果 miRNA生存分析结果表明,miR-17,miR-139,miR-323b,miR-365a,miR-551b,miR-7705,miR-877和miR-944与胃癌患者生存时间密切相关.KEGG通路和GO功能分析结果表明,靶基因主要富集在"pathways in cancer""MicroRNAs in cancer","MAPK signaling pathway","cell cycle"以及"apoptosis"等肿瘤相关通路.结论 筛选出关键miRNA及其靶mRNA与胃癌发生、预后密切相关,可作为新的潜在的治疗靶点和检测预后的生物标志物.

关键词：胃癌、miRNA、预后、生物标志物

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在线出版日期：2019-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：34-36