旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

为了研究旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶的功能,对GenBank中旋毛虫基因组数据库和旋毛虫EST数据库进行检索,获得旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的cDNA序列并设计引物.以旋毛虫肌幼虫总RNA为模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD18-T载体后测序并进行生物信息学分析.结果显示,成功克隆到3个旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的cDNA序列(TsTPx1,TsTPx2,TsTPx3).TsTPx1 cDNA含有1个由747个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码248个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质的理论分子质量为28.2 ku,理论等电点为9.00.TsTPx2 cDNA合有1个由588个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码195个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质理论分子质量为22.1 ku,理论等电点为6.52.TsTPx3 cDNA含有1个由594个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码197个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质理论分子质量为22.4 ku,理论等电点为6.08.TsTPx1、TsTPx2、TsTPx3都具有1个AhpC-TSA结构域和1个1-cys Prx_C结构域.同源性分析表明,TsTPx1、TsTPx2、TsTPx3与其他线虫硫氧还蛋白过氧化物酶的一致性在60％左右.

关键词：旋毛虫、硫氧还蛋白过氧化物酶、克隆、生物信息学分析

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分类号：S852.731(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31272555;甘肃省创新研究群体计划项目1210RJIA006

在线出版日期：2014-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：331-339