口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较

摘要：

为了查明我国新流行的口蹄疫病毒(FMDV)O型Mya98谱系猪源和牛源毒株的序列差异,采用RT-PCR方法,对FMDVO型Mya98谱系牛源毒株(O/BY/CHA/2010)和猪源毒株(O/GZ/CHA/2010)的基因组全序列进行了扩增和测序,并与O)型其他牛源和猪源参考毒株的基因组进行了比较分析.结果显示,O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株都属于SEA拓扑型的Mya98谱系毒株.O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株与来自Mya98谱系的其他毒株的全基因的核苷酸同源性大于98.0％.除了VP4、2A和3BCD区,O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株与Mya98谱系的其他毒株的其他基因区的同源性较低.与非SEA拓扑型毒株(UKG/7B/2007、Akesu/58和PanAsia谱系毒株)相比,在2A、P2和3CD区,具有较高的同源性,表明O/BY/CHA/2010和O/GZ/CHA/2010可能具有这些毒株的生长特性.进一步的序列分析表明,O/GZ/CHA/2010毒株在L蛋白第10位增加了1个亮氨酸,在S片段缺失70个核苷酸.试验结果为进一步分析氨基酸插入和核苷酸缺失对毒株致病性的影响奠定了基础.

关键词：口蹄疫病毒、全基因组、S片段、致病性

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分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目31302118;甘肃省科技重大专项计划项目1302NKDA027;国家高技术研究发展计划863项目2011AA10A211-1;甘肃省高层次人才科技创新创业扶持行动项目1013JHTA008;中国农业产业系统项目CARS-39

在线出版日期：2014-03-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：111-118