10.13422/j.cnki.syfjx.20230114
基于转录组数据的半夏AP2/ERF基因家族鉴定及逆境响应分析
目的:鉴定并研究半夏AP2/ERF转录因子的功能,为推进半夏品种的遗传改良提供理论依据.方法:该文基于半夏三代转录组数据鉴定了半夏中AP2/ERF家族成员,并对其进行系统的生物信息学分析,同时利用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测半夏AP2/ERF在不同组织及不同胁迫条件下的表达情况.结果:通过转录组数据共筛选出8个全长AP2/ERF转录因子家族成员,归为AP2、ERF和DREB3个亚家族;半夏AP2/ERF的氨基酸数目为251～512个,等电点为5.29～11.72,不稳定指数为45.90～82.41,且主要定位于细胞核中;半夏AP2/ERF基因的结构域和Motifs相对保守.组织特异性表达模式分析显示,半夏AP2/ERF基因在不同组织部位中具有不同的表达模式,且主要在叶中表达.逆境胁迫应答分析表明,PtERF1 主要响应NaCl的胁迫诱导;PtERF2和PtERF4在低温和聚乙二醇(PEG)胁迫下表达量均有较大幅度的上调;PtERF3同时响应低温和NaCl两种逆境的诱导;PtERF5同时响应高温、低温、NaCl、PEG胁迫诱导;PtERF7在高温胁迫下表达量增加;而PtERF8在低温胁迫下表达量的增加最为显著.结论:通过实验初步推测半夏AP2/ERF基因可响应逆境胁迫,可能具有调控半夏光合作用、提高根系抗逆能力等潜在功能.
半夏、AP2/ERF基因家族、基因鉴定、表达分析
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R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)
国家自然科学基金;国家自然科学基金;安徽省高校自然科学研究项目
2023-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
176-184
