基于ITS2和psbA-trnH条形码的藏党参的分子鉴定

摘要：

目的:应用内转录间隔区(ITS)2及psbA-trnH条形码技术,对藏党参各物种之间进行分子生物学鉴定.方法:通过提取4个物种(灰毛党参Codonopsis canescens、脉花党参C.foetens subsp.nervosa、党参C.pilosula、长花党参C.thalictrifolia var.mnollis)28份藏党参样品的基因组DNA,扩增ITS2及psbA-trnH序列并测序,并结合GenBank下载藏党参相关序列81条,包括15个物种,采用MEGA 6.0软件进行比对、变异位点分析、计算GC含量及种内和种间遗传距离,最大似然法(ML)、邻接法(NJ)、非加权组平均法(UPGMA)3种方法进行系统发育树的构建.结果:根据变异位点能将灰毛党参C.canescens、党参(党参 C.pilosula、川 党参 C.pilosula subsp.tangshen 及素花党参 C.pilosula var.modesta)、西藏党参 C.bhutanica、新疆党参C.clematidea、羊乳C.lanceolata、球花党参C.subglobosa及臭党参C.foetens区分;在系统发育树中,ITS2序列以ML法的聚类效果最佳,psbA-trnH序列以UPGMA法的聚类效果最佳,能对12个物种进行有效聚类区分.结论:ITS2及psbA-trnH条形码对单基原物种的鉴定率较高,但对变种与原变种间的鉴定仍存在一定局限性,这为后续藏党参物种之间的亲缘关系鉴定和临床应用等提供参考.

关键词：党参、DNA条形码、内转录间隔区(ITS)2序列、psbA-trnH序列、分子鉴定

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分类号：R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;国家重点研发计划;四川省科技厅应用基础项目

在线出版日期：2022-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：173-180