党参线粒体和叶绿体微卫星标记的开发及应用

摘要：

目的:由于不同基原和产地的党参有效成分差异较大,开发党参特异分子标记对于党参种质资源准确鉴定意义重大.方法:该研究应用生物信息学软件Primer 5.0,NTSYS-pc 2.10e,PopGene 32,对小党参Codonopsis minima叶绿体、秦岭党参C.tsinlingensis叶绿体和轮叶党参C.lanceolata线粒体基因组序列进行简单重复序列标记(SSR)位点搜索,利用Primer 5.0软件设计出120对SSR引物,筛选效果好且多态性高的16对cpSSR引物和10对mtSSR引物对20份党参材料进行种间通用性分析.结果:结果显示,分别从基因组序列中搜索到66个cpSSR位点和26个mtSSR位点,其中小党参叶绿体中单核苷酸(86.20％),二核苷酸(6.9％),三核苷酸(6.9％);秦岭党参叶绿体中单核苷酸(83.78％),二核苷酸(13.51％),三核苷酸(2.71％);轮叶党参线粒体中单核苷酸(46.15％),二核苷酸(53.85％).聚合酶链式反应(PCR)鉴定结果表明开发的26对SSR引物在党参属内具有很好的适用性.NTSYS-pc 2.10e软件分析显示20份党参材料的遗传相似系数在0.38～1.00,在阈值0.53处分为2个亚群.运用PopGene 32软件对20份党参进行多样性分析并筛选出4对多态性引物,分析发现观测等位基因数(Na)共为12个,有效等位基因数(Ne)为1.3629～2.6059个,各位点多态性位点百分率(PPL)均为100％,遗传学参数Ho,He,香浓指数(D的平均值分别为0.5558,0.4442,0.7532,说明各位点的多态性水平较高.以筛选出的4对引物对20份党参材料进行DNA指纹图谱绘制,发现DNA指纹图谱可将20份材料进行鉴别.结论:该研究可为党参属种间的亲缘关系和种内遗传分化研究提供分子依据.

关键词：党参;叶绿体;线粒体;微卫星;开发及应用

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分类号：R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)

资助基金：山西省重点研发计划项目;博士科研启动基金

在线出版日期：2021-12-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：153-162