杜仲TIFY转录因子鉴定与表达分析

摘要：

目的:从全基因组水平对杜仲(Eucommia ulmoides)TIFY基因家族进行鉴定与表达分析,以期为EuTIFYs基因功能深入研究奠定基础.方法:以杜仲基因组数据库为基础,通过美国国立生物技术信息中心(NCBI),MEME,PlantCare,白质分析专家系统(ExPASy)及TBtools等生物信息学分析软件,对杜仲TIFY基因家族进行鉴定,系统分析该基因家族的理化性质、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及其在叶片发育及杜仲胶形成中的表达模式.结果:该研究从杜仲基因组中共鉴定到14个EuTIFYs(EuTIFY1～EuTIFY14),氨基酸数目介于102～357,理论等电点分布在4.99～10.06,相对分子质量区域为10.8～39.14 kDa,亚细胞定位预测在细胞核中,均为亲水性蛋白,14个Eu TIF Ys分布在13条染色体上.系统进化分为TIFY,JAZ,ZML和PPD 4个亚家族,分别包含3个,4个,5个和2个EuTIFYs蛋白.EuTIFYs启动子区域含有多种光周期及非生物胁迫响应元件,参与植物杜仲生长发育和非生物胁迫.表达模式分析显示,EuTIFYs在杜仲叶片不同发育时期存在表达差异,大部分基因在叶片发育的早期阶段表达量较高,正调控杜仲胶的形成,EuTIFYs蛋白间存在多种互作关系.结论:该研究从杜仲全基因组水平鉴定到14个EuTIFYs,对其结构特点和表达模式进行全面的生物信息学分析,为进一步研究杜仲TIF Ys基因功能提供参考.

关键词：杜仲;TIFY转录因子;系统进化;表达分析

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分类号：R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)

资助基金：国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室开放基金项目;河南中医药大学博士科研启动基金项目

在线出版日期：2021-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：165-174