斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)脂质转运蛋白基因PdLTP3的克隆及其对干旱胁迫的响应

摘要：

以濒危荒漠植物斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)为对象,克隆脂质转运蛋白基因PdLTP3.运用Protparam、Multiple Sequence Alignment、MEGA、SignalP 4.1 Server、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL等软件对其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析,并检测干旱胁迫下PdLTP3基因的诱导表达情况.结果表明:从斧翅沙芥cDNA中克隆到PdLTP3基因全长,开放阅读框编码116个氨基酸,预测分子量为11.7 kD,理论等电点8.91,平均亲水性系数0.569,是一个疏水蛋白质;同源比对显示其编码的蛋白质与拟南芥AtLTP3相似度较高;PdLTP3蛋白N端1～23个氨基酸序列为信号肽序列;二级和三级结构显示PdLTP3蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲组成;干旱胁迫下PdLTP3基因表达量逐渐升高,5h后表达量约为胁迫处理前的48.6倍,说明其可能参与了斧翅沙芥干旱胁迫耐受.

关键词：脂质转运蛋白、斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)、生物信息学分析、干旱胁迫、基因表达

所属期刊栏目：38

分类号：Q943(植物学)

资助基金：国家自然科学基金项目31660116;中国科学院内陆河流域生态水文重点实验室开放基金项目KLEIRB-ZS-16-04;甘肃省自然科学基金项目1606RJYA243;西北师范大学青年教师科研基金项目NWNU-LKQN-15-14

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：578-583