艾氏蛇鳗线粒体基因组全序列结构分析和系统发育关系探讨

摘要：

本研究采用高通量测序技术获得了艾氏蛇鳗(Ophichthus evermanni)线粒体基因组全序列,并对其结构和特征进行了分析.结果表明,艾氏蛇鳗线粒体基因组全长17759 bp,包含了 13个蛋白编码基因(PCGs)、22个转运RNA基因(tRNA)、2个核糖体RNA基因(rRNA)、2个控制区(D-loop)和1个轻链复制起始区(OL).线粒体DNA全序列的碱基组成分别为A(31.27％)、G(16.19％)、C(26.22％)和T(26.32％),其中A+T含量(57.59％)大于G+C含量(42.41％),呈现出明显的A+T偏好性.与大多数硬骨鱼类不同,艾氏蛇鳗线粒体基因组中发生了基因重排现象,ND6基因和tRNA-Glu移到了tRNA-Thr和tRNA-Pro之间,且ND6基因上游还存在另一个高度同源的D-loop区.tRNA-Gln(Q)、tRNA-Ala(A)、tRNA-Asn(N)、tRNA-Cys(C)、tRNA-Tyr(Y)、tRNA-SerUCA(S1)、tRNA-Glu(E)、tRNA-Pro(P)和ND6 9个基因位于L链,其余基因均位于H链.除tRNA-Ser(AGC)外,其余21个tRNA均为典型的三叶草二级结构.分别采用邻接法和最大似然法,基于12个蛋白编码基因(ND6除外)构建了蛇鳗科鱼类系统发育关系树.结果显示艾氏蛇鳗与短尾蛇鳗(O.brevicaudatus)和食蟹豆齿蛇鳗(Pisodonophis cancrivorus)的亲缘关系较近,蛇鳗属是蛇鳗科鱼类中分化较晚的一个类群.研究结果丰富了蛇鳗科鱼类线粒体基因组数据库,也为该类群鱼类的系统分类研究提供了参考资料.

关键词：艾氏蛇鳗、高通量测序、线粒体基因组、系统发育分析

所属期刊栏目：29

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广东省渔业生态环境重点实验室开放基金;浙江省教育厅一般项目

在线出版日期：2022-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1264-1276