大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析

摘要：

为探究cGPDH和mGPDH在大黄鱼(Larimichthys crocea)适应低水温过程中所起的调控作用,本研究采用RACE-PCR技术克隆了大黄鱼cGPDH和mGPDH基因全长cDNA序列,cGPDH和mGPDH基因序列全长分别为1577 bp和2319 bp,包含长度为1050 bp和2193 bp的开放阅读框,分别编码349和730个氨基酸;氨基酸比对分析发现大黄鱼cGPDH和mGPDH与其他硬骨鱼类同源性较高,cGPDH包含一个特征性序列GXGXXG,mGPDH包含2个EF-hand功能结构域;进化树分析表明大黄鱼cGPDH和mGPDH与其他硬骨鱼类聚为一枝,与棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)亲缘关系最近.生物信息学分析发现大黄鱼cGPDH和mGPDH均不含跨膜结构域,cGPDH亚细胞定位于细胞质可能性最大,三维结构包含一个C端α螺旋底物结合结构,8个N端p折叠结构和一个单体结构,mGPDH定位于线粒体的可能性最大.qRT-PCR分析显示cGPDH和mGPDH在所检测的12个组织中均有表达,cGPDH mRNA主要表达在血液,其次为鳃、头肾和肠道,肌肉组织中表达量最低;而mGPDH mRNA在头肾表达量最高,肌肉组织表达量最低.在持续的冷胁迫下,水温15℃到9℃每天降温2℃,9℃到7℃每天降温1℃,7℃保持5d,大黄鱼cGPDH和mGPDH在脑和肌肉表达趋势均显著上调.研究结果表明,cGPDH和mGPDH基因可能在大黄鱼适应冬季低水温过程中发挥重要作用.

关键词：大黄鱼、cGPDH、mGPDH、低温、基因调控、基因表达

所属期刊栏目：28

分类号：S961(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金;福建省自然科学基金;福建省教育厅项目;实验室开放基金;厦门市科技计划

在线出版日期：2021-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：253-264