利用SSR、EST-SSR、SNP标记对鲤食物转化率、体厚、体质量3种性状的分析

摘要：

利用Windows Map Manager2.0的标记回归法对鲤(Cyprinus carpio L.)F2群体进行单标记定位分析.用91个SSR标记、33个EST标记、364个SNP标记对鲤进行全基因组扫描,结果得到与食物转化率、体厚、体质量3个性状显著相关(P＜0.05)的标记,分别为27、35、27个,其中与食物转化率相关的标记SNP0041、SNP0044,其相关性达到极显著水平(P＜0.001),贡献率分别达到15%、16%.这些标记可作为分子标记辅助育种的参考标记.将得到的与食物转化率显著相关的EST座位HLJEl4、HLJE253和与体质量显著相关的HLJE253座位在NCBI上进行BLAST比对,结果显示HLJE253与斑马鱼上编码ORF2结构蛋白的基因相关,相关程度达61%.将得到的与3种性状相关的SNP标记在NCBI上进行序列查找,通过Blast比对找到相关的基因,并对可能的功能作了注释.

关键词：鲤、EST-SSR、SNP、食物转化率、体厚、体质量

所属期刊栏目：18

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家973计划项目2010CB126305;农业部公益性行业科研专项200903045

在线出版日期：2011-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：565-573