4种海参16S rRNA和COI基因片段序列比较及系统学研究

摘要：

采用PCR技术对来自山东荣成、长岛、俄罗斯和日本的刺参(Apostichopus japonicus),来自澳大利亚的黄乳海参(Holothuria fuscogilva),来自冰岛的北大西洋瓜参(Cucumaria frondosa)和来自福建的二色桌片参(Mensamaria interce-dens)的16S rRNA和COI基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为500 bp和540 bp的片段.通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数进行基因序列变异分析.结果表明,根据16S rRNA、COI基因片段进行刺参种内差异比较时,长岛和荣成刺参序列差异最小,和日本刺参序列差异最大;刺参和其他科3种海参种间的序列差异远远高于刺参种内差异.从GenBank中选取7条海参序列与本研究所测序列一同构建了NJ和ME系统树.根据2种基因片段的系统学分析均表明,刺参属和拟刺参属亲缘关系很近,可能有共同的起源.而海参科未与同属于楣手目(Aspidochirolida)的刺参科聚类,而与枝手目瓜参科和沙子鸡科聚为一支,与形态学的分类不一致.[中国水产科学,2008,15(6):935-942]

关键词：海参、16S rRNA基因、COI基因、序列比较、系统发育分析

所属期刊栏目：15

分类号：Q959(动物学)

资助基金：国家科技支撑计划2006BAD09A01

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：935-942