斑点叉尾(鮰)趋化因子SCYA126基因及其可变剪接

摘要：

通过探针杂交筛选斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)BAC基因组文库,利用引物步移的方法对阳性克隆BAC047_K12进行序列测定,得到2 815 bp的SCYA126基因组序列.序列分析表明,SCYA126基因由2个外显子和1个内含子组成;外显子拼接的序列与SCYA126 cDNA序列完全一致,编码92个氨基酸,在N端含有2个相邻的半胱氨酸(CC)和2个不相邻的半胱氨酸,为典型的CC趋化因子亚家族成员;其上游调控序列包含TATA框启动子序列和一些与免疫相关的转录因子结合位点.另外,根据与GenBank接收号为BM029630的EST序列的比较分析,发现SCYA126基因组中的内含子没有被剪接,导致翻译后可能产生N端部分缺失的SCYA126蛋白.在胰脏和肝脏中确认了高表达的包含内含子的mRNA的存在,而且其表达量要明显高于正常剪接的SCYA126 mRNA.

关键词：斑点叉尾鮰、趋化因子、SCYA126、RNA可变剪接

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分类号：Q959.499(动物学)

资助基金：上海市教委资助项目Y1101;上海市科委资助项目06dj14003;上海市高校水产养殖E-研究支持项目E03009

在线出版日期：2007-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-7