马尔堡病毒密码子偏爱性分析

摘要：

目的 分析马尔堡病毒(Marburg virus,MARV)基因组密码子使用偏爱性及其影响因素,为疫苗及特异性抗体的制备提供参考.方法 使用EMBOSS以及Codon W、SPSS 26.0等软件对GenBank数据库中93条MARV编码序列进行分析,用SigmaPlot14.0、Graphpad Prism 9.5软件进行绘图.结果 MARV7种蛋白ENC均值分布在49.84～60.92之间,CAI值接近0.7.RSCU结果显示GCA、AGA、AAU、GAA、GGA、AUU、CCU、ACA是7种蛋白的共有高频密码子,其中具有偏爱性的密码子多以A/U结尾.中性分析、ENC-Plot分析和PR2奇偶分析表明MARV密码子使用偏爱性是由突变压力、自然选择和其它多种因素共同作用形成的,其中自然选择占主导作用.将MARV密码子使用频率与大肠埃希菌、酵母、人和杆状病毒4种常见表达系统进行比较,发现MARV与大肠埃希菌密码子使用频率更为接近.结论 MARV密码子使用偏爱性由多种因素共同作用形成的,自然选择占主导作用.大肠埃希菌表达系统更适合作为马尔堡病毒蛋白的体外表达.

关键词：马尔堡病毒、密码子偏爱性、自然选择

所属期刊栏目：40

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2024-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：520-528