新疆维吾尔自治区喀什地区亚洲璃眼蜱携带病原菌研究

摘要：

目的 采用16S rDNA V3-V4区高通量测序,并结合特异基因的PCR检测,研究新疆维吾尔 自治区喀什地区亚洲璃眼蜱体内菌群特征及常见病原菌携带情况,为当地蜱传疾病防控提供理论依据.方法 于2021年5月在喀什地区巴楚县采用布旗法采集游离蜱342只,经形态学和特异性16S rDNA检测鉴定蜱种;除228只用于分离培养外,其余114只提取全基因组DNA,采用Illumina Novaseq测序平台进行16S rDNA V3-V4区高通量测序,分析喀什地区亚洲璃眼蜱携带菌的种类及其相对丰度水平;根据新疆地区既往报道常见蜱媒病原菌分布情况及蜱种带菌特征,选取6种常见病原菌对其特异性基因进行PCR检测,分析各病原菌的携带情况,并与高通量测序结果进行比较分析.结果 16SrDNA V3-V4区高通量测序分析显示1个样本携带贝纳柯克斯体;所有样本在属水平均检出立克次体属,16个样本检出无形体属,但缺少种水平注释;所有样本均未检出疏螺旋体.PCR法检测表明14只蜱携带伯氏疏螺旋体,7只蜱携带米氏疏螺旋体,3只蜱携带嗜吞噬细胞无形体,2只蜱携带贝纳柯克斯体,斑点热立克次体及查菲埃立克体未检出.结论 与特异基因的PCR法相比,16S rDNA V3-V4区高通量测序能够同时检测多种病原体,但也存在其检测受限于数据库、无法检测到种水平等缺点.因此,在病原监测的实际应用中,两种方法应相互结合,才能更全面、准确的反应当地蜱媒病原菌的分布情况.

关键词：高通量测序、PCR、病原菌、蜱

所属期刊栏目：38

分类号：R384.4(医学寄生虫学)

资助基金：国家科技重大专项;国家科技重大专项

在线出版日期：2023-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：10-19