BCG感染树突状细胞的转录组测序和分析

摘要：

目的 通过转录组学筛选DC2.4细胞内BCG感染相关的差异表达基因和信号通路,为探索DC细胞抗分枝杆菌的胞内免疫机制提供科学依据.方法 以小鼠DC2.4细胞作为细胞模型,设置感染组和未感染组,感染组经BCG(MOI=2)感染,培养24 h后收集细胞,采用转录组测序技术(RNA-Seq)检测感染组和未感染组mRNA表达谱并结合生物信息学分析方法,筛选树突状细胞内与BCG感染相关的差异表达基因并进行qRT-PCR验证.结果 与未感染组相比,感染组差异表达基因共有27个(P＜0.05),其中26个上调基因,1个下调基因.通过GO和KEGG富集分析发现差异基因参与炎症反应、免疫系统过程等;TNF信号通路、IL-17信号通路以及细胞因子与细胞因子受体信号通路等参与BCG胞内感染过程.qRT-PCR验证与BCG感染相关的差异表达基因与转录组数据趋势一致.结论 BCG感染树突状细胞后,能够激发宿主细胞炎症反应和免疫应答,TNF、IL-17等信号通路参与BCG胞内感染过程.

关键词：卡介苗、树突状细胞、转录组测序、mRNA

所属期刊栏目：38

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：贵州省科技计划项目;遵义医科大学博士科研启动基金;贵州省遵义市红花岗区科技局项目

在线出版日期：2023-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1072-1079