10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.108
应用于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法初步比较分析
目的 筛选鉴定有助于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法.方法 收集18例结核性胸膜炎患者胸腔积液样本,分别采用6种方法提取核酸,应用微滴数字PCR技术分析样本中结核分枝杆菌特异性核酸IS6110和IS1081数量,以此评估不同胸腔积液核酸提取方法的优劣.结果 对于胸腔积液原液或胸腔积液离心上清,采用柱法和磁珠法提取的核酸样本中靶标数量无明显差别.对于胸腔积液离心沉渣,采用物理破碎法提取的核酸样本中IS6110和IS1081数量显著高于化学破碎法(IS6110,Z =-3.408,P= 0.001;IS1081,Z=-3.297,P = 0.001).相比于小体积(0.7 mL)胸腔积液原液直接提取,大体积(4 mL)胸腔积液离心的上清和沉渣(物理破碎)中提取的核酸样本含有更多的靶标数量(分别IS6110,Z =-3.237,P = 0.001,IS1081,Z=-2.667,P = 0.008;IS6110,Z =-3.157,P = 0.002,IS1081,Z =-2.250,P=0.024).结论 大体积胸腔积液离心上清游离核酸提取法和离心沉渣物理破碎核酸提取法能够富集更多的结核分枝杆菌核酸,是较好的用于结核性胸膜炎分子生物学检测的核酸制备方法.
结核性胸膜炎、结核病、结核分枝杆菌、胸腔积液、核酸、聚合酶链式反应、检测
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R378.91(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
北京市科学技术委员会首都临床诊疗技术研究;转化应用项目;国家自然科学基金;北京市自然科学基金;杜博平和李自慧对本研究有同等贡献
2022-09-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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