成都市人源沙门菌基因组特征分析

摘要：

目的 基于全基因组测序技术,探究成都市人源沙门菌的基因组特征,为监测与预防沙门菌感染提供资料.方法 收集35株成都市人源沙门菌(分离自腹泻患者粪便)进行全基因组测序.根据测序数据,进行血清型预测、耐药基因及可移动遗传元件预测、毒力因子注释及分布分析.结果 35株沙门菌分离株经全基因组测序,共预测到5种血清型,包括15株I4,[5],12:i:-沙门菌(13株为ST34、2株为新ST型)、12株鼠伤寒沙门菌(ST19)、5株肠炎沙门菌(ST11)、2株德比沙门菌(ST40)与1株火鸡沙门菌(ST463).35株沙门菌分离株共预测到10类42种不同的耐药基因,其中氨基糖苷类aac(6')-Iaa携带率为100％(35/35).I 4,[5],12:i:-沙门菌的耐药基因、质粒及插入序列数 目及种类多于其他血清型菌株.I 4,[5],12:i:-、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的毒力因子数目大于其他血清型菌株.部分鼠伤寒沙门菌有更高的毒力质粒、质粒编码菌毛和血清抗性毒力因子分布.结论 成都市人源沙门菌不同血清型菌株之间耐药基因、可移动遗传元件、毒力因子分布差异明显,值得在转录组、蛋白组进一步探究其耐药与毒力机制.

关键词：沙门菌、全基因组测序、耐药基因、毒力特征

所属期刊栏目：38

分类号：R378.2+2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划No.2018YFC1603900

在线出版日期：2022-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：433-440,446