陕西省鼠疫耶尔森菌间区规律短回文重复序列基因分型研究及流行病学分析

摘要：

目的 通过CRISPR(间区规律短回文重复序列)对陕西省鼠疫菌进行基因分型,分析流行病学特征,为陕西省鼠疫防治工作提供科学依据.方法 提取分离自陕西省鼠疫疫源地的66株鼠疫菌核酸,利用针对鼠疫菌的3对CRISPR引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序及分析,确定CRISPR基因分型.结果 66株鼠疫菌在3个位点上共有12种spacer,其中 YPa3种、YPb5种、YPc4种,具体为 a1′、a2′、a3′、b1′、b2′、b29′、b1″、b2″、c1、c2、c3、c3′,基因簇为 Cb2′,基因型分为 1′和4′两种.结论 疫情发生年份不同,鼠疫菌CRISPR基因型不同,鼠疫疫情处置进行溯源应将生态分型与基因分型结合.

关键词：陕西、鼠疫菌、间区规律短回文重复序列(CRISPR)、流行病学

所属期刊栏目：38

分类号：R516.8(传染病)

资助基金：陕西省重点研发计划项目No.2018SF-001

在线出版日期：2022-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：182-186