致病性钩端螺旋体的多位点序列分型研究

摘要：

目的 通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化.方法 应用16SrRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1 238株致病性钩体的基因种与MLST数据进行种群结构分析.结果 16SrRNA基因测序分析结果显示7株钩体国际参考菌株和47株国内菌株基因种主要为问号基因种,分别占比71.4％和59.6％.7株国际参考菌株呈现7种不同ST型.而在47株中国钩体分离株中,发现15种ST型及24种尚未报道的新ST型.MLST聚类分析发现问号、波氏和卫氏基因种菌株均各自形成单独分支.7株不同ST的疫苗株也位于问号基因种内不同亚分支中.系统发育进化树表明世界范围内近百年分离的1 238株钩体菌株主要包括16个进化簇,分别为ST17、ST34、ST149、ST1和ST37等,而中国236株钩体菌株可分为4个主要进化簇,主要流行基因型为ST1、ST128、ST17和ST143;不同国家流行菌株的基因种和ST型不尽相同.致病性钩体可在不同宿主物种广泛地交叉感染,不同国家间相互传播.结论 获得我国致病性钩体基因种和MLST基因多态性资料,并系统地了解国内和全球致病性钩体种群结构和遗传进化关系,为后续致病性钩体监测和溯源提供科学指导.

关键词：致病性钩体、多位点序列分型、16S rRNA基因测序、进化簇、系统发育

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分类号：R377.5+;R181.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金;医学微生物资源子平台运行与服务联合资助

在线出版日期：2022-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：95-101