应用16S rDNA分析青海喜马拉雅旱獭肠道菌群多样性

摘要：

目的 阐述青海喜马拉雅旱獭肠道菌群组成和群落结构,分析群落分布和种群遗传特征,探讨肠道菌群与环境因素之间的关系.方法 对来自青海省3个地理亚区的5个小区共计45份喜马拉雅旱獭粪便样本进行肠道微生物样品的收集,利用16S rDNA技术进行基因测序及微生物多样性分析,得到样本物种分类信息与相对丰度.基于OTU聚类做DCA分析探求肠道菌群与环境因子的关系,使用PICRUSt软件对肠道菌群的功能进行预测.结果 喜马拉雅旱獭的肠道菌群主要分布在6个门,10个属,且环境因素中温度、海拔、经度对其影响较大.功能预测发现遗传信息处理与代谢通路在肠道菌群中明显富集.结论 通过对青海喜马拉雅旱獭肠道菌群组的研究,为青藏高原的鼠疫防控提供具有实用价值的基础信息,还为及早发现新型病原体和更好的防控动物源性传染病提供理论依据,对未来相应学科的深入研究与快速发展具有重要价值与意义.

关键词：喜马拉雅旱獭;16S rDNA技术;肠道菌群

所属期刊栏目：37

分类号：R378.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室

在线出版日期：2021-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：773-782