1株重组H6N2禽流感病毒全基因组特征分析

摘要：

目的 掌握广州地区禽类市场H6N2亚型禽流感病毒的分子遗传特征,为禽流感的科学防控提供研究数据.方法 对禽类市场外环境分离株A/EN/Guangzhou/13565/2018(H6N2)进行全基因组序列测定,应用生物信息软件分析分子遗传特征.结果 A/EN/Guangzho u/13 5 6 5/2018(H6 N2)毒株各基因片段最大相似度毒株均为国内H6N2 禽流感病毒,核苷酸最大相似性在96.85％～98.22％之间,氨基酸最大相似性在96.30％～99.30％之间.各基因片段均属于欧亚谱系,HA、PB2、PB1、PA、M、NS基因归属于ST33 9-like分支,NP基因归属于HN573-like分支,发生多分支进化来源的重组.NA基因在HxN2 亚型基因中归属于H6N2 分支.该病毒为禽源低致病性病毒,但在PB2-89 位、PB1-473 位、PB1-F2 蛋白、PA-409位、M1-30/215位、NS1-42/205位均发生对哺乳动物致病性增强的氨基酸变异.结论 广州地区禽类市场监测发现的1 株重组H6N2禽流感病毒,属于禽源低致病性病毒,但存在发生跨宿主传播的潜在风险,需加强监测.

关键词：禽流感病毒、H6N2、基因重组、变异

所属期刊栏目：37

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广东省自然科学基金;广州市卫生和计划生育科技项目;广东省医学科学技术研究基金;广州市医学重点学科建设项目;国家科技重大专项

在线出版日期：2021-03-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：91-98