河流漫游球菌蛋白质组鉴定及功能初探

摘要：

目的 基于高精度串联质谱技术的蛋白质组方法,对河流漫游球菌的蛋白质组组分进行全面鉴定,并对其生物学功能开展探讨.方法 通过分离临床骨科患者深部组织穿刺液获得并鉴定得到一株河流漫游球菌,采用液相色谱一串联质谱系统开展无标定量蛋白质组实验,对河流漫游球菌进行蛋白质组组分鉴定,将分析所得的数据通过MaxQuant软件进行数据库检索完成蛋白质的鉴定和相对定量,并对鉴定出的蛋白质从生物学途径、分子功能和细胞组分,以及KEGG通路多个方面进行分类和注释分析.结果 通过3次质谱重复实验,共鉴定得到河流漫游球菌的1 372个蛋白质;通过功能注释分析发现大部分蛋白质主要参与维持细菌生存的转录翻译、代谢以及物质的生物合成等生物过程.结论 河流漫游球菌蛋白质丰度排名前10的主要为酶和核糖体蛋白,其中高富集蛋白质烯醇化酶、磷酸甘油酸激酶为参与糖酵解功能的关键酶,并有可能与河流漫游球菌毒性密切相关.本研究构建的河流漫游球菌蛋白质组表达谱数据集为临床河流漫游球菌的诊断与治疗提供了新的蛋白质组实验数据参考.

关键词：河流漫游球菌、质谱、蛋白质组、功能注释

所属期刊栏目：36

分类号：R378.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：贵州省联合基金资助项目No.黔科合LH字[2017]7097

在线出版日期：2021-01-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：900-906