布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析

摘要：

目的 探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究.方法 采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析.A19基因组3 286 167 bp,预测3 371个基因,GC含量57.25％.通过注释COG库,对应基因有2 560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2 544个基因,共参与33类代谢通路.结果 综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关.结论 通过分析发现,A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因.本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路.

关键词：布鲁氏菌、布鲁菌疫苗株A19、全基因组测序、比较基因组学研究

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分类号：R378.5(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：内蒙古科技厅农业资助项目;内蒙古科技厅项目;内蒙古高等教育研究院项目

在线出版日期：2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1002-1008