福氏志贺菌PFGE和MLVA分子分型方法的应用与评价

摘要：

目的 比较和评价脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析技术(MLVA)在福建地区福氏志贺菌研究中的应用.方法 运用PFGE和MLVA技术对43株分离自福建地区的福氏志贺菌进行分子分型,结合流行病学资料分析比较分型效果.结果 43株福氏志贺菌经PFGE分型后相似度在61.70％～100％之间,按照100％的相似水平可分为36个PFGE型,没有优势PFGE型别,分辨系数为0.992 2,存在4个优势簇(G1～G4);福氏志贺菌经MLVA分型后,按照100％的相似水平可分为41个MLVA型别,遗传关联度介于6.207％～100％之间,没有优势MLVA型别,分辨系数为0.997 8,得到5个优势基因群(Cluster1～5).在最小生成树上,部分F4c与Fx亲缘关系较近,并都由F2a和F1a分支而来,表现出一定的遗传关系.结论 两种分型方法的分辨率基本一致,PFGE分型结果与流行病学背景资料及血清型别基本吻合,MLVA在分析菌株种群进化关系上更具优势.

关键词：福氏志贺菌、PFGE、MLVA、遗传进化

所属期刊栏目：35

分类号：R378.21(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：福建省卫计委中青年骨干人才培养项目2017-ZQN-20

在线出版日期：2019-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：245-249,253