结核分枝杆菌调节miRNAs及circRNAs抗细胞自噬机制的生物分析

摘要：

目的 探索结核分枝杆菌抵抗人或小鼠巨噬细胞自噬机制的关键miRNAs及circRNAs,为寻找新型结核诊断标志物及治疗靶点提供思路.方法 筛选出结核分枝杆菌诱导细胞差异表达的自噬相关基因;制作蛋白交互图并文献挖掘筛选关键自噬基因;多数据库综合预测相应的miRNA,制作自噬基因mRNA-miRNAs交联图并筛选关键miRNA;制作miRNAs-circRNAs相互作用图并筛选关键circRNA.结果 筛选出18种结核感染后差异表达的自噬相关基因,并在此基础上预测16种自噬关键基因;筛选出4种通过靶向自噬mRNA参与自噬调控的关键miRNA分子(miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p);针对4种miRNA筛选出6种与其密切相关的circRNA分子,并预测hsa-circRNA2908和hsa-cir-cRNA6439是影响结核抗自噬关键circRNA分子.结论 miR-miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p及其上游共同调控分子hsa-circRNA2908和hsa-circRNA6439可能是潜在的诊断标志物和疾病治疗靶点.

关键词：结核分枝杆菌、巨噬细胞、自噬基因、miRNA、circRNA、相互作用

所属期刊栏目：34

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金81470001;山东省自然科学基金ZR2016HM09

在线出版日期：2018-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：888-894,907