2015-2016年深圳市登革Ⅲ、Ⅳ型分离病毒株E/NS1基因序列特征

摘要：

目的 了解2015-2016年深圳市分离的登革Ⅲ、Ⅳ型病毒E/NS1基因序列特征及登革Ⅲ、Ⅳ型病毒流行规律,探究其可能的传播来源.方法 收集2015-2016年深圳市登革热患者病例资料及急性期血清,用C6/36细胞培养分离登革病毒,用FQ-PCR对其进行血清分型,分离成功的病毒株用反转录-聚合酶链反应(PCR)方法扩增E基因和NS1基因,进行序列分析,绘制系统进化树,氨基酸比对分析4个不同血清型NS1蛋白.结果 从5份Ⅲ型的登革病毒标本中成功分离4份病毒株,3份Ⅳ型登革病毒标本中成功分离2份登革病毒;BLAST分析保守E基因结果表明,与DENV-3分离株同源性最高(99％)的毒株主要是印度尼西亚2010和2015年分离株、菲律宾2015年分离株.与DENV-4分离株同源性最高(99％)的毒株主要是菲律宾2013年分离株、印度尼西亚2010分离株、意大利2009年分离株.NS1基因序列分析显示所选4株不同血清型的病毒株氨基酸相似性为77.69％,4个不同血清型的登革热NS1抗原存在5-7个氨基酸保守区域.结论 2015-2016年深圳市输入的登革Ⅲ、Ⅳ型病毒可能来自印度尼西亚和菲律宾,应加强出入境人员的监测工作,避免输入引起本地感染的风险.

关键词：登革病毒、E基因、NS1基因、进化树

所属期刊栏目：34

分类号：R373.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：深圳市科技创新基础研究.JCYJ20160427151920801,JCYJ20151029151932602

在线出版日期：2018-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：629-634