结膜吸吮线虫基因组中分泌蛋白的规模预测及分析

摘要：

目的 在对结膜吸吮线虫基因组数据进行注释的基础上对其中分泌蛋白进行规模预测及分析.方法 联合应用SignalP、TMHMM、MEME、Protcomp、big-PI Predictor和SecretomeP等多种生物信息学软件进行分析,完成了结膜吸吮线虫分泌蛋白组的预测,对其进行GO功能富集、KEGG通路分析、结构域统计以及具有抗原性分泌蛋白预测等分析.结果 结膜吸吮线虫合有约259个分泌蛋白,其长度多集中在100-700 aa;GO功能分析发现这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中;KEGG分析显示分泌蛋白在药物及谷胱甘肽代谢中发挥着重要作用;候选分泌蛋白的结构域分析发现存在最多为糖水解酶结构域;大规模筛选预测到126个分泌蛋白具有B细胞表位抗原性的功能.结论 结膜吸吮线虫分泌蛋白多为小型蛋白,推测这些蛋白可能参与糖代谢、抗氧化活性,协助虫体的入侵及其在宿主体内的寄生.

关键词：结膜吸吮线虫、分泌蛋白组、分泌蛋白、糖代谢

所属期刊栏目：34

分类号：R383.1(医学寄生虫学)

资助基金：the National Natural Science Foundation81560336;the Project from the Guizhou Province Technology Hall[2016]1168;the Project from Innovation Team of the Guizhou Provincial Department of Education No.[2014]39国家自然科学基地区项目81560336;贵州省科技厅基金黔科合基础[2016]1168;贵州省教育厅创新团队黔合教人才团队字[2014]39号

在线出版日期：2018-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：12-17,22