鸭坦布苏病毒甲基转移酶的序列分析和结构预测

摘要：

为了确定鸭坦布苏病毒(duck Tembusu virus,DTMUV)发挥甲基转移酶(methyltransferase,MTase)功能的氨基酸序列.本研究运用生物信息学方法,以已知的黄病毒MTase的序列和结构为模板,对GenBank上注入的DTMUVMTase序列进行同源比对分析和结构预测.分析结果表明,DTMUV MTase与WNV,DENV-2,JEV三种病毒MTase的核酸序列同源性分别为64.76％,64.55％,67.33％,氨基酸序列同源性分别为74.71％,68.45％,75.15％;其可能结构含有SAM结合位点且具有典型的4个α螺旋和7个β折叠的黄病毒MTase的结构特点;同时,DTMUV MTase序列上存在黄病毒MTase经典保守位点K-D-K-E;从而为确定DTMUV MTase属于黄病毒MTase家族成员提供一些理论依据.

关键词：鸭坦布苏病毒、甲基转移酶、序列分析、结构预测

所属期刊栏目：33

分类号：R39;R73

资助基金：the Application and Base Research Project of Sichuan Science and Technology Department No.2017JY0014.四川省科技厅应用基础研究项目资助2017JY0014

在线出版日期：2017-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：877-881