多耐药大肠埃希菌NB8株全基因组耐药基因检测

摘要：

目的 检测1株多耐药大肠埃希菌NB8株的遗传学背景.方法 病原分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液,作16S rDNA和gyrA基因测序、BLASTn比对确认为大肠埃希菌,采用Illumina HiSeq与Ion Torrent PGM两种大规模并行测序仪进行全基因组分析,再行人工测序.最后NB8株和9株已完成全基因组测序的大肠埃希菌耐药基因的比较基因组学研究.结果 多耐药大肠埃希菌NB8株全基因组测序得到一条推定的染色体序列,长4 550 369 bp(内含14个缺口),得到一条推定的质粒序列,长635 377 bp(内含33个缺口).从NB8株全基因组数据中挖掘出了β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类、大环内酯类、磺胺类、四环素类、多粘菌素的耐药基因,并挖掘出接合性质粒、转座子、插入序列、整合子的遗传标记,以及5大类外排泵基因.结论 多耐药大肠埃希菌NB8株遗传学背景明确,主动外排机制增强也会导致或者增强NB8株的耐药性.质粒、转座子和整合子等可移动遗传元件可以使细菌的耐药性得以快速传播,使受体菌表现为多重耐药.

关键词：大肠埃希菌、全基因组、多耐药、耐药基因、可移动遗传元件、外排泵基因

所属期刊栏目：32

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：the Ningbo Natural Science Foundation2012A610186;the Zhejiang Traditional Chinese Medicine foundation No.2011ZB126.宁波市自然科学基金2012A610186;浙江省中医药基金2011ZB126

在线出版日期：2016-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：741-745