嗜血杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立及在树鼩检测中的应用

摘要：

目的 建立树鼩中嗜血杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为树鼩微生物质量控制提供参考.方法 应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对NCBI中6株嗜血杆菌的外膜蛋白序列设计简并引物.通过4株嗜血杆菌标准菌株和24株它属菌株进行特异性和敏感性评价,将建立CODEHOP PCR检测方法,应用于树鼩嗜血杆菌的检测.结果 简并引物HF1/HR8和HF3/HR3扩增标准菌株副鸡嗜血杆菌(ATCC 29545)、溶血嗜血杆菌(ATCC 33390)、流感嗜血杆菌(ATCC 33391)、副流感嗜血杆菌(ATCC 33392)的目的片段分别为506 bp～535 bp和344 bp～390 bp,经测序和NCBI Blast比对,结果准确.两对引物组合,能够有效的区分嗜血杆菌属菌株与它属菌株,检测限最低可达2.1 pg/μL.在受试的野生树鼩呼吸道样本中嗜血杆菌阳性率为33.3％(20/60).结论 所建立的方法具有较好的特异性和敏感性,操作简便,能够用于动物样品的嗜血杆菌检测.

关键词：嗜血杆菌、CODEHOP PCR、树鼩、简并引物、检测

所属期刊栏目：31

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：the Standardization of Experimental Tree Shrews and the Integrated Demonstration of Creation and Application of Major Human Disease Models of Tree Shrews2014BAI01B01;国家科技支撑计划项目2014BAI01B01

在线出版日期：2015-12-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：994-1000