云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析

摘要：

目的 对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础.方法 利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析.结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的5'和3'端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功.同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1％).系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV.结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础.

关键词：猪戊型肝炎病毒、巢式逆转录PCR、全长基因组分析

所属期刊栏目：31

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助31360619;云南省自然科学基金2013FB032,2011FZ068;中国博士后科学基金No.2014M562672资助,杨臣臣和龙飞燕同等贡献;the Natural Science Foundation of China31360619;the Natural Science Foundation of Yunnan Province in China.2011FZ068 and 2013FB032;the China Postdoctoral Science Foundation2014M562672

在线出版日期：2015-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：547-551