结核分枝杆菌Rv3134c蛋白抗原表位的预测

摘要：

目的 预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184 195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高.该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248 255位氨基酸残基或其附近.BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低.结论 结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础.

关键词：结核分枝杆菌、Rv3134c蛋白、抗原表位、二级结构、预测

所属期刊栏目：31

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重大传染病防治科技重大专项基金资助项目2012ZX10003008002;军队医学科技“十二五”重点项目BWS11J050;北京市科技创新基地培育与发展工程专项项目Z141107004414021;grants from the National Science and Technology Major Infectious Diseases of Major Funded Project2012ZX10003008002;the Military Medical Science "Twelve Five" Key ProjectBWS11J050;the Beijing Technology Innovation Base Nurturing and Development Special ProjectsZ141107004414021

在线出版日期：2015-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：541-546