广州地区2012年1、2型登革病毒基因型特征研究

摘要：

目的 测定广州市2012年1、2型登革病毒(DENV 1、DENV 2)的E基因序列,探讨其来源及基因型.方法 收集广州市2012年478例登革热患者急性期血清478份,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR法扩增全长E基因,测定序列并绘制系统发育树,结合流行病学资料进行分子流行病学分析.结果 478例患者标本中分离到DENV 1 6株,DENV 22株,测序获得E基因序列,E基因长度均为1 485 bp,编码495个氨基酸,DENV 1碱基同源性为97.4%~99.9%,推导的氨基酸同源性为99.2%~100.0%,其同源性与2011、2006和2004年份的国内DENV 1流行株接近.DENV 2碱基同源性为91.3%,推导的氨基酸同源性为97.8%,其同源性与我国DENV 2流行株相对较远.进化分析发现,DENV 1均属于同一亚型,即亚洲型,DENV 2属于两个亚型,即马来西亚/印度次大陆和东南亚型.结论 推测广州市2012年DENV 1和DENV 2均为输入性,DENV 1可能由柬埔寨和广东佛山输入,DENV 2可能由孟加拉国和缅甸输入.

关键词：登革病毒、E基因、序列测定、系统发育树

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分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：美国国立卫生研究项目IR01A1083202-01A1;国家科技重大专项2012ZX10004-213-005;广州市医药卫生科技项目20121A011122,20131A011115,201102A212006

在线出版日期：2014-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：207-212