2010-2012年福建省H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析

摘要：

目的 通过对2010-2012年福建省分离的H3N2亚型流感毒株血凝素HA1基因进行分析,了解2010-2012年福建省H3N2亚型流感病毒的基因特征和变异规律.方法 随机选择28株毒株,提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增目的片段,纯化PCR产物后进行测序;利用DNAstar和Mega4.0等生物信息学软件进行核苷酸整理、拼接、校对、差异性比较以及基因进化树构建等分析研究.结果 28株H3N2亚型流感病毒HA1区核苷酸同源性在96.4％～100％之间.基因系统进化分析显示,其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸,序列的差异和年代成正比.2010-2012年间HA1区共出现43个氨基酸位点的变化,其中有10个氨基酸位点变异累计涉及4个抗原决定簇,2个变异位点发生在受体结合位点(RBS)及其附近,应予高度重视.结论 相对于A/Perth/16/2009疫苗代表株,2012年的部分H3N2亚型流感出现了抗原漂移;部分毒株已出现氨基酸位点的改变,并涉及抗原决定簇及受体结合位点,提示2010-2012年福建省人群中流行的H3N2亚型流感正逐渐发生变异,应加强流感病原学监测,以及时发现新的流感变异株,为福建省流感防控提供科学依据.

关键词：甲型流感、H3N2亚型、HA1基因、特征、变异

所属期刊栏目：29

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：the Key Science and Technology Program of China2013ZX10004104;the Youth Research Foundation of Fujian Provincial Department of Health No.2011-1-27国家科技重大专项2013ZX10004104;福建省卫生厅青年科研基金2011-1-27

在线出版日期：2014-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1157-1161