let-7c与其靶基因细胞因子在肺结核痰液中的表达及其功能分析

摘要：

目的 检测microRNAlet-7c及其靶基因细胞因子在肺结核患者痰液中的含量变化,并用生物信息学技术和软件对let-7c的功能进行预测分析,为进一步阐明let-7c在结核感染中的作用奠定基础.方法 用核酸杂交和定量PCR检测健康对照和活动性肺结核病人的痰液中let-7c的含量;用TargetScan与PicTar预测let-7c的靶基因,用DAVID数据库和Cytoscape的BINGO插件对let-7c的预测靶基因进行GO注释分析和生物通路分析;用ELISA法检测let-7c靶基因细胞因子IL-10与IL-6在痰液中的水平变化.结果 杂交和PCR结果表明:let-7c在活动性肺结核患者痰液中的含量均比健康对照组显著降低 (P<0.05).let-7c预测靶基因的GO注释结果富集在负性调节细胞间通讯等生物学过程及胞外基质构成等分子功能方面 (P<0.05);在KEGG通路数据库中let-7c预测靶基因主要富集于MAPK、钙离子信号通路与TGF- beta信号通路等方面(P<0.05).痰液中let-7c的靶基因细胞因子IL-10的含量显著增高.结论 let-7c在活动性肺结核感染病人痰液中的含量明显降低,let-7c靶基因细胞因子IL-10明显增高,let-7c的靶基因主要参与细胞信号通讯、刺激反应、信号转导等生物学过程.这些结果为进一步深入研究let-7c在结核感染中调控功能奠定了基础.

关键词：肺结核、let-7c、靶基因、IL-10、生物信息学

所属期刊栏目：29

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金项目81100006;山东省自然科学基金 ZR2010HM073 联合资助

在线出版日期：2013-06-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：385-388,411