10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.04.011
3株人源猪链球菌2型湖南株cps2J、gdh、ef基因进化分析
目的 对3株人源猪链球菌2 型(S.suis 2)湖南株(HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102)cps2J、gdh、ef基因进行序列测定和进化分析,了解其变异和进化状况,为人感染S.suis疫情的防控提供数据.方法设计S.suis 2 cps2J、gdh、ef基因PCR引物,对HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102株进行PCR扩增和序列测定,测序结果利用Lasergene 和Mega5软件进行分析.结果 cps2J、gdh、ef基因包含的完整开放阅读框( ORF) 分别为999 bp、1 347 bp、2 532 bp,分别编码333、448、843个氨基酸.在线BLAST 同源性分析表明,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102 株属于S.suis 2,3菌株cps2J、gdh、ef 基因组序列之间的核苷酸同源性均为100%;进化树显示,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102 株与国内外猪源和人源S.suis 2 菌株属于同一分支,同源性比较显示3株S.suis 2 湖南分离株cps2J、gdh、ef基因与其他国内外S.suis 株核苷酸序列同源性分别为99.8%~100%、96.4%~100%和99.7%~100%,氨基酸同源性分别为98.5%~100%、98.7%~100%和99.5%~100%.结论 3 株人源S.suis 2 湖南株cps2J、gdh、ef基因序列与国内外S.suis 2 菌株相应基因序列同源性高,变异程度小.
猪链球菌2型、cps2J基因、gdh基因、ef基因、进化分析
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R378.1(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
长沙市科技计划项目K0902167-31
2013-06-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
369-374