羊口疮病毒F1L蛋白二级结构分析与表位预测

摘要：

目的 利用软件预测羊口疮病毒(ORFV)F1L蛋白的二级结构和细胞表位.方法 利用SOPMA服务器预测ORFV F1L蛋白的二级结构,以DNAStar软件单参数(二级结构、亲水性、可及性、柔韧性及抗原性)预测结果为基础,通过二级结构预测初步筛选,并以ABCpred方案作为最终验证,预测羊口疮病毒(ORFV) F1L蛋白的B细胞表位;运用神经网络+量化矩阵法(ANNs+QM法)预测ORFV F1L蛋白的CTL细胞表位;使用MHC-II类分子结合肽在线程序预测ORFV F1L蛋白的Th细胞表位.结果 ORFV F1L蛋白含有α-螺旋34.71%、β-片层18.82%、β-转角5.88%、无规则卷曲40.59%;没有信号肽,可能存在7个B细胞表位, 2个CTL表位,3个Th细胞表位.结论 该研究结果将为建立ORFV诊断方法、制备单克隆抗体及合成肽疫苗提供理论依据.

关键词：羊口疮病毒、F1L基因、二级结构、细胞表位、预测

所属期刊栏目：28

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家现代肉羊产业技术体系CARS-39

在线出版日期：2013-02-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1185-1190