MLVA方法在军团菌分子分型中的应用评价

摘要：

目的 探讨MLVA方法在军团菌分型中的可应用性.方法 选用文献报道的9个军团菌VNTR位点,对我国环境水中分离的81株Lp1型军团菌菌株和2株参考菌株进行分子分型研究,并与PFGE和SBT分型结果进行了比较.结果 81株分离菌株9个VNTR位点的等位基因型别数分别为6,3,4,2,3,3,2,4和7,其中部分菌株的某些位点无扩增产物或产物为非目的 片断.7个位点PCR产物具有重复单元;Lpms3位点PCR产物无重复单元;Lpms31位点部分菌株PCR产物有重复单元,另一些菌株无重复单元.对于具有重复单元的序列,不同菌株间以及同一菌株内各重复单元的序列变异均较大,3个位点存在不完整的重复单元.根据8个位点的PCR产物电泳结果,81株Lp1型分离菌株分为19个MLVA型.通过PFGE和SBT方法,81株Lp1型分离菌株分别分为46种PFGE带型和21种ST型.结论 MLVA方法的分型能力不及PFGE方法,而与SBT方法分型能力相当.但是,MLVA方法操作简单、成本低廉,而且可对培养阴性的标本进行分型,因此,该方法适合在基层推广应用.

关键词：军团菌、嗜肺军团菌、分子分型、MLVA

所属期刊栏目：28

分类号：R183.3(流行病学与防疫)

资助基金："十一五"科技重大专项2008ZX10004-007,2008ZX10004-008

在线出版日期：2012-05-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：256-260,283