10.3969/j.issn.1002-2694.2012.03.008
我国分离的10株狂犬病病毒P和M蛋白基因序列分析
目的 探讨我国狂犬病病毒P、M蛋白基因序列的结构特点及变异情况.方法 用RT-PCR方法从分离的10 株具有代表性的狂犬病病毒中获得目的 基因片段,测定核苷酸序列后,利用生物信息学软件分析核苷酸、氨基酸序列及其相关的功能位点并构建P、M蛋白基因的系统发育树.结果 10 株病毒P和M基因核苷酸序列同源性分别为85.9%~99.4%和89.5%~99.5%,推导出的氨基酸同源性分别为92.3%~100%和96.0%~99.5%.在核苷酸及氨基酸水平上,10 株病毒与我国分离的街毒株HN10及CTN疫苗株的P、M基因同源性均明显高于国外其它疫苗株、标准攻击毒CVS株相应的同源性.系统发育分析表明,10 株病毒与我国湖南街毒株、CTN疫苗株进化关系最近,而与研究中选取的其他毒株进化关系较远.氨基酸对位分析表明,与其它基因1型毒株相比,本研究中10 株狂犬病病毒的P、M基因出现多处变异,但很少在功能区发生变异.结论 分离的10 株病毒属基因l型狂犬病病毒,与我国分离的街毒株及CTN疫苗株关系较近.
狂犬病病毒、遗传特征、P基因、M基因
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R373.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
国家高技术研究发展计划 863计划项目2007AA02Z402
2012-05-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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